常用Ubuntu做科研，这是常用的一些配置指南。
Anaconda常用操作
源管理
查看当前源
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conda config --show-sources
更换清华源
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conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
可能需要删除默认源，对于卡在solving environment的情况:
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conda config --remove channels defaults
环境配置
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conda info --envs
conda create --name semi python=3.6 tensorflow=1.12 matplotlib=2.2.3 opencv=3.4.2
conda activate semi
conda deactivate
conda remove -n flowers --all
NVIDIA驱动安装
先禁用nouvea
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sudo gedit /etc/modprobe.d/blacklist.conf
末尾添加
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blacklist nouveau
更新内核
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sudo update-initramfs -u
重启。确认生效
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sudo reboot
lsmod | grep nouveau
没有输出即可
安装驱动
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sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa
sudo apt update
识别显卡模型和推荐的驱动
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ubuntu-drivers devices
安装驱动
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sudo apt install nvidia-driver-410 nvidia-settings nvidia-prime
或者
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sudo ubuntu-drivers autoinstall
重启生效
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sudo reboot
科学上网
安装ShadowSocks
1.1 系统自带安装
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sudo apt update
sudo apt install python-pip
sudo pip install shadowsocks
1.2 或者(recommend)
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sudo apt update
sudo apt install python-pip
sudo apt install git
sudo pip install -U git+https://github.com/shadowsocks/shadowsocks.git@master
2.1 设置.json文件, 或用2.2下载模版
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{
"server":"my_server_ip",
"local_address": "127.0.0.1",
"local_port":1080,
"server_port":my_server_port,
"password":"my_password",
"timeout":300,
"method":"aes-256-cfb"
}
2.2 下载模版
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wget -P /etc https://raw.githubusercontent.com/zbhoscar/storage/master/shadowsocks.json
3 单次启动ShadowSocks(unrecommended)
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sslocal -c /etc/shadowsocks.json -d start
ShadowSocks服务
1.1 先写一个.service文件, 或者用1.2下载模版
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sudo pluma /lib/systemd/system/shadowsocks.service
填写如下内容. 注意: sslocal可以通过which sslocal找到
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[Unit]
Description=Shadowsocks Client Service
After=network.target
[Service]
Type=simple
User=root
ExecStart=/usr/bin/sslocal -c /path/shadowsocks.json
[Install]
WantedBy=multi-user.target
1.2 懒得写命令行:
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wget -P /lib/systemd/system https://raw.githubusercontent.com/zbhoscar/storage/master/shadowsocks.service
2 载入service系统
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systemctl enable /lib/systemd/system/shadowsocks.service
实际上是在link到/etc/systemd/system/multi-user.target.wants下
3 服务管理
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service shadowsocks start
service shadowsocks stop
最终效果是给本机 ip 127.0.0.1的1080端口科学加成，可以配置浏览器和软件用来科学。
比如系统自带firefox浏览器中，设置手动代理，选择socks5 DNS，加入科学端口就可以了。
更全面的讲解
Proxychains
通过ShadowSocks的建立的本地端口给指令科学加成
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sudo apt install proxychains
配置/etc/proxychains.conf
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socks5 127.0.0.1 1080
示例: 通过proxychains启动Dropbox
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proxychains dropbox start -i #启动后可能提示缺少python-gpgme, install即可
服务器远程控制
命令行控制
需要在受控机器与本机在同一网络下
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ssh usrname@server_ip
图形界面控制
受控机器使用VNC做图形界面控制，需要与本机在同一网络中
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sudo apt-get install vnc4server # 最新版本看官网
vim /home/用户名/.vnc/xstartup
内容修改
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# &x-window-manager & # 注释掉
exec /usr/bin/mate-session & # 针对mate界面
重启服务
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service vncserver restart
使用方法
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ssh usrname@server_ip # 本机命令行登陆受控机器
vncserver -geometry 1024x768 :id # 受控机器开启界面，注意是x不是*
vncviewer server_ip:id # 本机登陆vnc登陆受控机器
vncserver -kill :id # 受控机器关闭界面
ps -ef | grep 'vnc' | grep id # 受控机器检测vnc端口id被占用
硬盘挂载
Samba远程文件夹
Check smb in servers:
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/etc/samba/smb.conf
Windows系统
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任意界面 `win + R`
> 输入 \\受控机器的ip\文件夹名 <
> 输入 账号密码 <
Ubuntu系统
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文件夹界面 `Ctrl + l`
> 输入 smb://受控机器的ip/文件夹名/
> 输入 账号密码 <
/home挂载
NFS硬盘挂载
Boot引导修复Grub
先决环境
U盘启动，试用ubuntu，联网。
打开终端，添加boot-repair所在的源：
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sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo apt-get update
安装boot-repair:
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sudo apt-get install -y boot-repair
运行boot-repair:
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sudo boot-repair
一般选择recommanded repair即可，启动项重启生效
启动项查看
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sudo efibootmgr
启动项删除
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sudo efibootmgr -b 000A -B
Ubuntu环境文件
/etc/profile为系统的每个用户设置环境信息,当用户第一次登录时,该文件被执行，并从/etc/profile.d目录的配置文件中搜集shell的设置。/etc/environment在登录时操作系统使用的第二个文件,系统在读取你自己的profile前,设置环境文件的环境变量。/etc/bash.bashrc为每一个运行bash shell的用户执行此文件，当bash shell被打开时,该文件被读取。~/.profile:每个用户都可使用该文件输入专用于自己使用的shell信息,当用户登录时,该文件仅仅执行一次，默认情况下,他设置一些环境变量,执行用户的.bashrc文件，每个用户应当在这里添加自己的环境配置。~/.bashrc包含专用于你的bash shell的bash信息,当登录时以及每次打开新的shell时,该文件被读取，终端配色在这里修改。~/.bash_logout当每次退出系统(退出bash shell)时，执行该文件。 相互关系/etc/profile中设定的变量(全局)的可以作用于任何用户,而~/.bashrc等中设定的变量(局部)只能继承/etc/profile中的变量,他们是”父子”关系。
每次登录之后加载profile和bashrc的流程
1) /etc/profil –> /etc/profile.d/*.sh
2) $HOME/.profile –> $HOME/.bashrc
生效不用重启
source profile, source bash
环境变量·自定义
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export PATH=/usr/local/cuda-8.0/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-8.0/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
export LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-8.0/lib64:$LIBRARY_PATH
export PYTHONPATH=/home/zbh/Desktop/caffe-ssd/python:$PYTHONPATH
终端相关
readline插件
解决使用Shell时⬆⬇⬅➡乱码的问题，在Ubuntu16中貌似不需要
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sudo apt-get install libreadline-dev ， 不然安装python3的方向键会乱码
terminator终端
很好用的终端，戒不掉
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sudo apt-get install terminator
右键打开终端选项
很实用，需要重启，在Ubuntu16中貌似不需要
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sudo apt-get install nautilus-open-terminal
终端配色
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sudo gedit ~/.bashrc
替换相似PS1行，并设置force_color_prompt=yes
这是一种配色方案：
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PS1='${debian_chroot:+($debian_chroot)}\[\033[01;36m\]\u\[\033[01;36m\]@\[\033[01;36m\]\h\[\033[01;36m\]:\[\033[01;33m\]\w\[\033[01;36m\]\$ \[\e[m\] '
数据格式相关
超级解压缩
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apt install pigz
tar --use-compress-program=pigz -xvpf ucfTrainTestlist.tar.gz -C ./test
安装rar
解压RAR出Parsing Filters is unsupported
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sudo apt-get install unrar
U盘exFat格式支持
可能需要重启，反正Ubuntu16不需要
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sudo apt-get install exfat-fuse exfat-utils
其他
GCC/G++ multi
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sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
sudo apt-get update
gcc -v
ls /usr/bin/gcc*
sudo apt-get install gcc-4.5 gcc-4.5-multilib g++-4.5 g++-4.5-multilib
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.4 50
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.5 40
sudo update-alternatives --config gcc
sudo update-alternatives --remove gcc /usr/bin/gcc-4.5
FFMPEG
解决编译OpenCV出错的问题
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sudo apt-get install librubberband-dev libx264-dev libvpx-dev
./configure --enable-gpl --enable-version3 --enable-nonfree --enable-libx264 --enable-librubberband --enable-libvpx
Firefox使用本地账户
在附加组件(addons)中添加附加组件管理器(addons manager)
设置工作区
在software center中设置unity tweak tool
